バーチャルコース「細菌ゲノムの全ゲノムシーケンシング:ツールとアプリケーション - バーチャルコース - Coursera」は、さまざまなコンテンツのコースで、約 7 時間のビデオクラスを提供しています。 完成までXNUMX時間。 その重要な機能を確認し、オレンジ色のボタンをクリックして、Coursera e-Learning プラットフォームの詳細情報を入手してください。
このコースでは、医療分野との関連性が高まっている細菌ゲノムの全ゲノム配列決定 (WGS) のトピックを扱います。
従来の方法が WGS 技術に置き換えられているため、WGS の技術とアプリケーションは国際的な政治的議題の上位にあります。したがって、この分野で働く人々がデータを分析し、解釈可能な結果を取得できるようにするために、バイオインフォマティクス ツールは非常に重要です。
と、さまざまな目的で使用されます。
このコースは、種の同定、抗菌薬耐性と病原性形質のタイピングと特徴付け、およびプラスミドの特徴付けを含む、細菌監視におけるWGSアプリケーションを理解し、慣れるための基礎を学生に提供します。
また、学生は、オンライン ツールと、これらのツールの一部を使用する方法のデモンストレーションや、学生が無料で入手できる WGS 分析ツールを使用して解決するための演習を通じて、オンライン ツールを何に使用できるかについて学ぶ機会を得ることができます。
このコースを修了すると、次のことができるようになります。 1.
細菌の分類における一般原則を説明してください 2.
細菌性病原体と抗菌薬耐性の監視のための全ゲノム配列決定の応用例を挙げてください 3.
サブタイピングとサーベイランスにゲノムツールを適用する 4.
次世代シーケンスの概念を定義し、NGS 5 シーケンス データについて説明します。
生の読み取りからコンティグへの de novo アセンブリを行う方法を説明してください 6.
種の同定、MLST タイピング、および耐性遺伝子検出のためのツールの背後にある方法を挙げてください 7.
他の細菌や病原体のゲノムの実際のケースで、種の識別、MLST タイピング、および耐性遺伝子の検出のためのツールを適用します。
8.
Salmonella と E. のタイピング ツールの背後にあるメソッドを説明する.
大腸菌、プラスミドレプリコン検出およびプラスミドタイピング 9.
Salmonella と E. を入力するためのツールを使用します。
大腸菌、プラスミドレプリコン検出、および他の細菌および病原体ゲノムの実際のケースでのプラスミドタイピング。
10.
概念を説明し、統合された細菌分析パイプラインを使用してバッチ分析とゲノムデータのタイピングを行えるようにする 11.
SNP 12 に基づいて系統樹を構築する方法を示します。
系統発生ツールを適用して系統樹を構築し、細菌または病原菌株の関係を説明します 13.
独自の配列データベースを作成する方法を説明してください 14.
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デンマーク工科大学 (DTU)
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